Detection of caga gene and typing vaca gene of helicobacter pylori in biopsies of patients with gastric symptoms in Cumana, sucre state, Venezuela | Detección del gen caga y tipificación del gen vaca de helicobacter pylori en biopsias de pacientes con sintomatología gástrica en Cumaná, estado Sucre, Venezuela

Resumen

ABSTRACT

Helicobacter pylori has been associated with gastric diseases such as gastritis, ulcers, lymphoma gastroduodenal and is considered a risk factor for the development of gastric cancer. The aim of this study was to characterize vacA genotypes and to determine the presence of cagA gene in biopsies from patients with gastric symptoms treated at the University Hospital Antonio Patricio de Alcalá of Cumaná, Venezuela. Sixty nine patients with endoscopic indication were evaluated using the polymerase chain reaction (PCR). Only 42 (60.86%) of those patients were positive for amplification of vacA and/or cagA and of these, 54.76% amplified for both genes. The predominant genotype was m1s1 (61.90%) followed by mixed infections (33.33%), being the most frequent associations among strains with genotypes m1s2, m2s2 and m1s1. From the biopsies performed 72.5% were negative for the cagA gene. However, this was found to be associated mainly to genotype m1s1 (17.39%). Statistically highly significant correlations were found among the allelic forms m1 and s1 (ρ = 0.732), s2 and m2 (ρ = 0.643), significant m1 and s2 (ρ = 0.279). Gene cagA showed highly significant correlations with m1 (ρ = 0.509), m2 (ρ = 0.447) and significant with s1 (ρ = 0.319) and s2 (ρ = 0.263). These results show the existence of co-infections with different genotypes of H. pylori in the studied population. They, would explain in part the low incidence of severe gastric pathologies despite being present in the region virulent genotypes of this bacterium. The high percentage of coinfections observed could be the result of the influence of geographic and ethnicity factors in the region where the study was conducted..

Key words: H. pylori, genotyping, gastritis.

RESUMEN
Helicobacter pylori, ha sido asociado a patologías gástricas y es considerado un factor de riesgo para el desarrollo de cáncer gástrico. El objetivo de este estudio fue caracterizar los genotipos de vacA y la presencia del gen cagA en biopsias provenientes de pacientes con sintomatología gástrica atendidos en el Hospital Universitario Antonio Patricio de Alcalá de Cumaná, Venezuela. Se evaluaron 69 pacientes con indicación endoscópica, empleando la reacción en cadena de la polimerasa. Sólo 42 de ellos (60,86%) mostraron ser positivos para la amplificación de vacA y/o cagA y de éstos el 54,76% amplificó para ambos genes. El genotipo predominante fue m1s1 (61,90%) seguido de infecciones mixtas (33,33%), siendo más frecuentes las asociaciones entre cepas m1s2 con los genotipos m2s2 y m1s1. El 72,5% de las biopsias fueron negativas para el gen cagA. Sin embargo, este se encontró asociado principalmente al genotipo m1s1 (17,39%). Estadísticamente, se encontraron correlaciones muy significativas entre las formas alélicas m1 y s1 (ρ = 0,732), s2 y m2 (ρ = 0,643), significativas m1 y s2 (ρ = 0,279). El Gen cagA mostró correlaciones muy significativas con m1 (ρ = 0,509), m2 (ρ = 0,447) y significativas con s1 (ρ = 0,319) y s2 (ρ = 0,263). Estos resultados muestran la existencia de coinfecciones por distintos genotipos de H. pylori en la población estudiada, que explicaría en parte la baja incidencia de patologías gástricas severas a pesar de estar presente en la región genotipos virulentos de esta bacteria. El elevado porcentaje de coinfecciones observado podría ser el resultado de la influencia de factores geográficos y de etnicidad de la región donde se realizó el estudio.

Palabras Clave: H. pylori, genotipficación, gastritis.